早在1924年,吳考盤年僅21歲即以深厚的功底撰著了《百大名家合注傷寒論》。嗣后,又相繼出版了《金匱要略五十家注》、《本經(jīng)集義》、《難經(jīng)集義》、《素靈輯粹》、《黃帝素問集成》等多部著作。這些宏篇巨論,鐘鼎長垂,深受國內(nèi)外中醫(yī)學家的重視,成為當時研究古醫(yī)籍的重要參考書籍。吳考盤被公認為著名的經(jīng)典醫(yī)著的注釋家。著名中醫(yī)學家秦伯未在《百大名家合注傷寒論》序中贊曰:“曲者癖之,直者彰之,破千古之歧說而歸于一”。
20世紀五十年代,吳考盤在教學工作之余,又相繼完成了《傷寒論百家注》和《金匱要略百家注》。1961年出版了《麻黃湯六十五方釋義》。
“文革”期間,學術(shù)研究之風一度低落,吳考盤仍一腔熱忱,竭力探求中醫(yī)學術(shù)真諦。至 “文革”以后,先后參加了《諸病源候論校注》、《難經(jīng)校釋》等審修工作,并相繼審閱了《素問校釋》、《靈樞經(jīng)校釋》、《甲乙經(jīng)校釋》、《脈經(jīng)校釋》和《中藥大辭典》等多部著作。在工作之余,吳考盤還夜以繼日地進行了《黃帝素靈校勘》、《傷寒論百家注》、《金匱要略百家注》、《神農(nóng)本草經(jīng)選解》、《難經(jīng)正義》、《脈學釋義》、《醫(yī)學隨錄》、《醫(yī)學求真》、《江蘇醫(yī)著》等書籍的補充修訂與撰寫并均公開出版。
先后還在全國各類雜志上發(fā)表學術(shù)論文60余篇,每篇都力求有所創(chuàng)新,示人以啟迪。如《(素問)衍文》、《(素問)錯簡》、《(傷寒論)辨證簡析》、《(金匱要略)的探討》、《營衛(wèi)探討》、《五行與醫(yī)學》、《方藥探討》、《運氣擇言》、《漢唐以前醫(yī)學成就簡介》、《醫(yī)理衡正評議》等論文。